Mithilfe von htaccess kann man unter Anderem auch Verzeichnisse vor unberechtigtem Zugriff schützen - dies lässt sich mithilfe der htaccess-Authentication machen. Neben kompletten Pfaden lassen sich aber auch einzelne Dateien schützen.
Hierzu schränkt man den Zugriff auf die Authentifizierung einfach mittels der Direktive ein.

Weitere Informationen:
http://httpd.apache.org/docs/2.0/howto/auth.html
http://www.webmaster-toolkit.com/htaccess-generator.shtml